Após vencer um torneio subterrâneo brutal, Baki Hanma sigue em direção à batalha contra sus pai, Yuujirou, o homem mais forte do planeta. Mas ele não tem tempo de relaxar cuando Tokugawa Mitsunari, o corror do evento, aparece na escola para lhe dar uma noticia: cinco prisioneiros incrivelmente perigosos – todos mestres nas artes marciais e oriundos das corridas da morte ao redor do mundo – escaparam contemporaneamente e estão no caminho de Tóquio, cada um ansoso por provar o sabor da derrota. Tokugawa adverte que, por dar fama à sua força, Baki vai encontrá-los cedo ou tarde, e ele não será o único alvo. Baseado na primeira saga da segunda série de mangás, esta parte de Baki concentra-se em uma guerra total entre os renomados artistas marciais japoneses e o sombrio mundo subterrâneo.