Perder alguém querido é tão doloroso que, às vezes, a vontade de trazê‑lo de volta surge; essa fraqueza é explorada pelo enigmático Milênio Earl. Para transformar suas armas mecânicas em “Akuma”, ele recorre às almas dos mortos que são convocadas. Quando uma alma entra num Akuma, fica presa para sempre, e a única forma de libertá‑la é exorcizá‑a da criatura com a arma Anti‑Akuma, chamada “Inocência”.
Após três anos como discípulo do General Cross, Allen Walker chega à Ordem Negra – um grupo de pessoas dispostas a combater Akuma e o Conde do Milênio – para se tornar exorcista oficial. Armado com um braço que funciona como sua Inocência e possuindo um olho amaldiçoado capaz de enxergar as almas atormentadas dentro dos Akuma, Allen e seus companheiros exorcistas têm a missão de impedir o plano final do Milênio Earl, que pode levar à destruição do mundo.