Yuugo Hachiken é um estudante dedicado, trabalhador e cansado de tentar atender às expectativas que simplesmente não consegue cumprir. Com a chegada do novo ano escolar, ele decide ingressar no Colégio Agrícola Ooezo, um internato situado na zona rural de Hokkaido, buscando fugir do estresse imposto pelos pais. No início, convencido de que se daria bem nesse ambiente, Hachiken logo descobre que está longe da realidade quando confrontado com colegas talentosos que vivem em fazendas a vida inteira e dominam quase tudo sobre alimentos, vegetais e até fisiologia do gado. Acordar às cinco da manhã para trabalho árduo ou cuidar de animais torna-se rotina, mas Hachiken permanece um completo amador na dura vida agrícola.
Gin no Saji acompanha a história cômica desse jovem enquanto ele tenta se adaptar a um cenário totalmente novo, conhecendo inúmeras pessoas únicas ao longo do caminho. Enquanto luta para apreciar seu entorno, Hachiken anseia descobrir seus sonhos, de modo que possa viver uma vida gratificante em seus próprios termos.
