A saga de Cho Hatsumei Boy Kanipan segue em ritmo constante, apresentando a jovem inventor em destaque.
Kanipan agora tem a idade da adolescência e ainda mantém seu prestígio como inventor famoso.
Num dia comum, um navio misterioso cai do céu e se atranca numa praia deserta.
Dentro dele há uma humanóide feminina que não lembra quem é.
Cabe a Kanipan reviver as memórias da criatura, e ele acaba descobrindo, por acidente, que o planeta dela está em grave perigo enquanto ele se empenha na batalha.
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