Em Destino/Apócrifo, o cenário se desenrola em um mundo paralelo ao de Destino, onde o Grande Graal foi retirado de Fuyuki após a Terceira Guerra do Santo Graal e ficou desaparecido por muitos anos. Por volta dos anos 2000 – época que teria coincidido com a Quinta Guerra do Santo Graal – o grupo que saqueou o Graal, Yggdmillennia, declara abertamente sua secessão da Associação de Mago e afirma estar em posse do artefato. A Associação então envia cinquenta magos para recuperá‑lo; todos, exceto um, são imediatamente massacrados por Lancer de Preto. O sobrevivente consegue ativar o sistema reserva do Grande Graal, permitindo a convocação de quatorze Servos no total. Isso marca o início da Grande Guerra do Santo Graal em Trifas, dividida entre duas facções: a Facção Negra, composta pelos membros de Yggdmillennia, e a Facção Vermelha, formada pelos enviados pela Associação de Mago, salvo um representante da Igreja. O próprio Graal ainda convoca o Governante para atuar como mediador da guerra.
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