No ano de 2024, o jovem Shiki foge de casa para morar com seu avô Taizou, que dirige o serviço marítimo Ushio na ilha artificial chamada Standard Blue. Quatro anos antes, o pai de Shiki morreu em um acidente no mar profundo, e ele agora tenta descobrir mais sobre o homem que foi seu pai, pois a família dele está profundamente ligada ao oceano. A tripulação da Ushio – Gruff Takeshi e Taichun – vê Shiki como um obstáculo, mas ele os supera com entusiasmo e coragem. Quando a mãe de Shiki aparece em busca dele, porém, o perigo se aproxima e ele é colocado à prova final.
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