Kotaro é um prodígio da robótica que atrai a atenção de uma organização maléfica. Eles querem que ele ajude a construir seu império de máquinas e fortalecer suas criações artificialmente inteligentes, os B'ts (pronunciados “bates”). Quando o Império captura Kotaro, ele pode não ter escolha senão trabalhar para eles, salvo se seu irmão mais novo, Teppei, conseguir resgatá‑lo. Contudo, após um poderoso B't e seu mestre atacarem Teppei, parece que a última esperança de Kotaro desapareceu. Entretanto, o sangue derramado por Teppei desperta um lendário B't—essas criaturas malignas são ativadas pelo sangue—e agora Teppei possui uma das mais mortais e sencientes, o B't X, sob seu comando. Mesmo assim, os irmãos enfrentam um exército do Império das Máquinas, com as probabilidades contra eles. Ainda que sobrevivam, B'X não quer confrontar outra criatura do Império.
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