Invasores misteriosos ameaçam a Terra. Para combater essa ameaça, um grupo de estudantes de elite é recrutado para jogar videogames que secretamente os treinam para a verdadeira batalha que se aproxima.
Mas esses jovens não estão interessados em jogos. Shinji, Rei, Asuka e Kaworu têm prioridades mais urgentes. Eles precisam aprender a operar o Evangelion, um robô gigante capaz de salvar o mundo das invasões. Mas para isso, precisam superar seus próprios medos e limitações.
Essa turma não tem tempo para jogos, pois enfrentará desafios que vão além do controle remoto. Eles precisam se preparar para a luta real, porque os videogames são apenas o começo de uma jornada épica.