Depois de refletir sobre a realidade do futebol japonês, a Associação de Futebol Japonês decide contratar o treinador Jinpachi Ego para realizar seu sonho de conquistar a Copa do Mundo. Acreditando que o Japão não tem um atacante com personalidade forte e sede de gols, Jinpachi inicia o Blue Lock, uma prisão onde trezentos talentosos jogadores de escolas de ensino médio de todo o país são isolados e colocados uns contra os outros. O único sobrevivente do Blue Lock ganhará o direito de se tornar o atacante da equipe nacional, enquanto aqueles que forem derrotados serão proibidos de se juntar à seleção para sempre.
Selecionado para participar desse projeto arriscado é Yoichi Isagi, um atacante que falhou em levar seu time de futebol da escola ao torneio nacional. Depois de escolher passar a bola para um colega que errou em vez de marcar sozinho, ele não poderia deixar de se perguntar se os resultados seriam diferentes se ele fosse mais egoísta. Usando essa oportunidade de ouro oferecida pelo Projeto Bloqueio Azul, Yoichi visa esclarecer suas dúvidas e perseguir seu sonho final de se tornar o maior atacante do mundo e levar o Japão à glória da Copa do Mundo.
